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項目介紹

分子動力學（Molecular Dynamics，MD）模擬是一套分子模擬方法，是研究凝聚態(tài)系統(tǒng)的有力工具。通過分子動力學模擬，研究者得到體系原子的運動軌跡，可觀察到原子運動過程的各種微觀細節(jié)。通過對研究體系的動態(tài)模擬，我們能夠在分子水平上理解生物大分子的運動與生物功能、蛋白-小分子之間相互作用機理、納米材料分子的自組裝過程。分子動力學模擬是理論計算和實驗方法的有力補充，廣泛應(yīng)用于物理、化學、材料科學和生物醫(yī)藥等領(lǐng)域。

樣品要求

1. 科研計算服務(wù)是一個探索的過程，其中存在不確定性。所有模擬計算只保證計算方法正確，至于結(jié)果是否完全符合客戶預期無法保證。

（例如，DFT所用泛函本身采用了很多近似；另外當前的模擬方法也存在很多近似（例如OER過程的吉布斯自由能計算中會忽略掉催化劑的表面電荷富集效應(yīng)與溶劑效應(yīng)等），這都有可能導致計算結(jié)果和實驗結(jié)果出現(xiàn)分歧（即某一問題可能是多種因素共同作用的結(jié)果，單純考慮其中某一作用不足以反應(yīng)要研究的問題本質(zhì)，目前也尚未有任何計算方法可以完全實現(xiàn)模擬仿真條件與真實實驗條件的完全一致，因此研究問題的哪個方面需要由客戶最終決定），因此，我們在計算過程中會盡可能減少可以避免的誤差，但是有些誤差受限于理論本身，不可避免，我們對此引發(fā)的后果不承擔任何責任。此外，分子力學或者分子動力學等基于分子力場的模擬計算重現(xiàn)性可能不如第一性原理計算，因此不保證兩次獨立的相同體系相同任務(wù)的模擬可以得到完全定量一致的結(jié)果，對此引發(fā)的分歧，我們不承擔任何責任）。

2. 請?zhí)峁╆P(guān)于結(jié)構(gòu)或者實驗條件盡可能詳細的信息。

比如材料中是否有缺陷，空位，是異質(zhì)結(jié)，還是負載團簇模型等。如果不提供影響計算的關(guān)鍵信息，計算老師按著自己的理解去計算，由此導致的結(jié)果和費用，請客戶自行承擔。

3. 原始數(shù)據(jù)保存6個月。

由于超算平臺的數(shù)據(jù)吞吐量較大，因此原始數(shù)據(jù)我們無償為客戶保存6個月，超過6個月的原始數(shù)據(jù)將會被刪除，請客戶知曉。且在6個月內(nèi)只提供原始數(shù)據(jù)，不再接受其他相關(guān)請求。

4. 嚴格按照計算方案約定計算

除本方案約定內(nèi)容之外，客戶如有其他特殊需求，請?zhí)崆案嬷?。如果需要補充計算可以補充下單。本著學術(shù)嚴謹?shù)膽B(tài)度，我們無法接受“人為調(diào)一下結(jié)果”，“調(diào)下參數(shù)使之更靠近我的預期”此類要求，所有計算結(jié)果尊重原始結(jié)果數(shù)據(jù)，敬請客戶不要提出這種要求。如果客戶下單后，又提出此類要求，我們有權(quán)利退單，由此造成的機時浪費及經(jīng)濟損失由客戶承擔。

5. 客戶如對計算結(jié)果有異議，可以申請復核。

復核僅僅檢查“計算方法是否存在錯誤”，“計算參數(shù)是否不合理”，“數(shù)據(jù)導入過程是否存在失誤”等問題，如果上述檢查均沒有問題，則認定計算結(jié)果不存在理論上的錯誤，這種情況下，不接受任何無償性質(zhì)的計算測試以及重新計算要求，請客戶知曉！

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