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蛋白組+代謝組聯(lián)合分析

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蛋白組+代謝組聯(lián)合分析

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項目介紹

代謝組學(xué)可以研究某一生物、組織或細(xì)胞在特定環(huán)境下的特定時期內(nèi)所有低分子量代謝產(chǎn)物。相比其他組學(xué)，代謝組與表型有著更近的聯(lián)系。蛋白組和代謝組緊密聯(lián)系，蛋白水平會影響代謝產(chǎn)物的表達(dá)譜，而代謝物濃度又會影響蛋白表達(dá)量。代謝組學(xué)分析可以幫助蛋白組數(shù)據(jù)在功能上進(jìn)行解釋；而蛋白質(zhì)組學(xué)分析通過突出參與的酶或酶促途徑，有助于更好地理解代謝組學(xué)數(shù)據(jù)。蛋白組學(xué)與代謝組學(xué)整合分析能夠更好地解釋疾病或外界刺激的分子機(jī)理和不同組學(xué)對通路的調(diào)控機(jī)制，更直觀地了解代謝物、酶及基因之間上下游的調(diào)控關(guān)系。

分析方法

篩選出差異表達(dá)的蛋白和代謝小分子，基于O2PLS關(guān)聯(lián)分析進(jìn)行多變量整合分析。對差異蛋白與差異代謝小分子進(jìn)行斯皮爾曼（Spearman）相關(guān)性分析，并進(jìn)一步構(gòu)建相關(guān)性網(wǎng)絡(luò)。然后，將差異蛋白和差異代謝小分子映射到iPath 整體代謝通路和KEGG 通路上，并進(jìn)行KEGG 富集分析。最后，利用Cytoscape 中的Metscape 插件進(jìn)行蛋白組和代謝組的互作網(wǎng)絡(luò)分析。

樣品要求

詳情請聯(lián)系技術(shù)經(jīng)理。

項目案例