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    蛋白修飾位點(diǎn)motif分析

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    項(xiàng)目介紹

         大規(guī)模的蛋白質(zhì)組學(xué)實(shí)驗(yàn)可以在一次實(shí)驗(yàn)中鑒定出數(shù)千種蛋白質(zhì)翻譯后修飾位點(diǎn)，了解引起這些修飾的潛在生物學(xué)過(guò)程是蛋白質(zhì)組學(xué)的重要研究方面，例如了解酶對(duì)其底物的偏好性可以幫助闡明它們涉及的生物途徑。由于酶對(duì)給定底物的部分生化偏好可能是由修飾位點(diǎn)周圍的殘基決定的，因此生物化學(xué)家將研究重點(diǎn)放在確定引起特定酶 - 底物相互作用的關(guān)鍵相鄰殘基上，這種蛋白或多肽序列形成的特定殘基模式稱為基序（Motif）。

    分析方法

          使用 Motif-x 或 iceLogo 分析方法預(yù)測(cè)修飾位點(diǎn)的潛在基序（Motif）特征。將鑒定到的修飾位點(diǎn)上下游各 10 個(gè)（磷酸化修飾為上下游各 6 個(gè)）氨基酸組成的肽段序列作為分析對(duì)象，背景為物種中所有潛在發(fā)生修飾位點(diǎn)上下游各 10 個(gè)（磷酸化修飾為上下游各 6 個(gè)）氨基酸組成的肽段序列，從翻譯后修飾位點(diǎn)周圍提取具有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義的生物學(xué)基序 。

    樣品要求

    詳情請(qǐng)聯(lián)系技術(shù)經(jīng)理。

    項(xiàng)目案例

    修飾位點(diǎn) Motif 特征 iceLogo 圖形展示

    修飾位點(diǎn)附近氨基酸出現(xiàn)頻率富集熱圖

    Motif 特征 logo 圖

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