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    項目介紹

    基因組學(xué)：基因組學(xué)是對生物體所有基因進行集體表征、定量研究及不同基因組比較研究的一門交叉生物學(xué)學(xué)科。基因組學(xué)主要研究基因組的結(jié)構(gòu)、功能、進化、定位和編輯等，以及它們對生物體的影響。

    動植物基因組

    動植物基因組de novo測序、遺傳變異檢測、BSA性狀定位、遺傳圖譜構(gòu)建、群體進化、全基因組關(guān)聯(lián)分析、SSR分子標(biāo)記開發(fā)

    人基因組

    全外顯子組測序、人基因組重測序、目標(biāo)區(qū)域捕獲測序

    微生物基因組測序

    細菌基因組de novo測序、細菌基因組重測序、真菌基因組de novo測序、真菌基因組重測序、病毒基因組測序、線粒體&葉綠體基因組測序、質(zhì)粒&BAC克隆子基因組測序

    樣品要求

    1. 送樣需標(biāo)清樣品編號，封口處用封口膜密封；

    2. 送樣前請與技術(shù)人員溝通送樣條件，樣品保存期間切勿反復(fù)凍融。

    樣本類型送樣要求
    動植物基因組樣本
    植物組織嫩葉鮮重2g
    高等或大型動物肌肉組織鮮重2g
    微體型動物動物體累計鮮重2g
    昆蟲正常體型3g，微體型2g
    血液（抗凝）正常體型3g，微體型2g
    微生物基因組樣本（建議送樣量3倍以上）
    細菌框架圖菌體0.1g/核酸0.2μg
    細菌完成圖pacbio（革蘭氏陰性菌）菌體0.5g/核酸5μg
    細菌完成圖pacbio（革蘭氏陽性菌）菌體0.7g/核酸5μg
    細菌完成圖nanopore菌體0.5g/核酸3μg
    人基因組樣本
    基因組DNA濃度≥20ng/μl,總量≥2μg
    血液（抗凝）新鮮血液2-3ml，-20℃保存


    項目案例
    常見問題
    1、基因組框架圖和精細圖有什么不同？

    框架圖能覆蓋基因組常染色體區(qū)域90%，覆蓋基因區(qū)域95%，Contig N5到5 kb，Scaffold N50達到20 kb，單堿基錯誤率在十萬分之一以下。精細圖能覆蓋基因組常染色體區(qū)域95%，覆蓋基因區(qū)域98%，Contig N5到20 kb，Scaffold N50達到300 kb，單堿基錯誤率在十萬分之一以下。

    2、動植物基因組從頭測序時為什么需要構(gòu)建不同類型的文庫？

    因為動植物基因組大、復(fù)雜度高，且存在大量的重復(fù)區(qū)域，因此需要制備不同梯度的測序文庫，進行雙末端測序，使得在拼接中能夠跳過大范圍的重復(fù)區(qū)，從而避免了基因組中重復(fù)序列造成 的錯拼，提高了拼接的質(zhì)量；同時結(jié)合BAC或Fosmid文庫以及多種測序平臺的綜合運用，保證了測序的準(zhǔn)確性和基因組的完整性，從而完成高等動植物的基因組圖譜繪制。

    3、外顯子組測序需要多少的覆蓋深度？

    測序深度根據(jù)研究目的、樣本量及客戶的預(yù)期而定，建議有效測序深度100×以上，單基因遺傳病推薦至少100×，腫瘤等體細胞突變疾病推薦200×以上。

    4、人全基因組測序的優(yōu)勢是什么？

    人全基因組測序可以挖掘各種遺傳變異，一些大的結(jié)構(gòu)變異，與全外顯子測序相比，不局限于編碼區(qū)變異，可以在全基因組范圍內(nèi)尋找與疾病或功能相關(guān)的位點。

    基因組

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