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    染色質(zhì)構(gòu)象捕獲（Hi-C）

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    染色質(zhì)構(gòu)象捕獲（Hi-C）

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    項目介紹

    Hi-C技術(shù)源于染色體構(gòu)象捕獲 （Chromosome conformation capture, 3C）技術(shù)，以整個細胞核為研究對象，利用高通量測序技術(shù)，結(jié)合生物信息分析方法，研究全基因組范圍內(nèi)整個染色質(zhì)DNA在空間位置上的關(guān)系，通過對染色質(zhì)內(nèi)全部DNA相互作用模式進行捕獲，獲得高分辨率的染色質(zhì)三維結(jié)構(gòu)信息。

    技術(shù)特點：

     1. 研究全基因組范圍內(nèi)整個染色質(zhì)DNA在空間位置上的關(guān)系

     2. 基因組組裝組裝水平提升到染色體水平。

     3. 無需群體，單個個體就能實現(xiàn)染色體定位，周期短，成本低

     4. 相對遺傳圖譜，標(biāo)記密度更大，序列定位更完整

    實驗流程：

    分析流程：

    標(biāo)準(zhǔn)分析

    （1） 數(shù)據(jù)過濾及比對

    （2） ChIP分布趨勢分析

    高級分析

    （3） 染色體互作分析

    （4） 與ChIP聯(lián)合分析

    （5） 轉(zhuǎn)錄組聯(lián)合分析

    （6） 染色體三維結(jié)構(gòu)模型構(gòu)建

    樣品要求

    細胞數(shù)：≥1ⅹ107     交聯(lián)固定后干冰運輸

    項目案例
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