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蛋白質(zhì)乙?;揎?/p>

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     蛋白質(zhì)乙?;揎椨梢阴;D(zhuǎn)移酶和去乙?;腹餐{(diào)節(jié),通過感應(yīng)代謝環(huán)境變化而變化,同時其常在代謝酶上發(fā)生修飾,進而調(diào)控代謝通路及代謝酶的活性,參與下游代謝物變化。蛋白質(zhì)乙?;╝cetylation)是最常見的?;揎楊愋?,是指在乙?;D(zhuǎn)移酶的催化下把乙酰基團(如乙酰輔酶A等供體)共價結(jié)合到底物蛋白質(zhì)的賴氨酸殘基上的過程,主要發(fā)生在蛋白質(zhì)賴氨酸殘基的ε-NH2位,其分子質(zhì)量會相應(yīng)增加42.01Da,質(zhì)譜能夠準確地測定分子量是否發(fā)生相應(yīng)的質(zhì)量偏移,實現(xiàn)?;揎楇亩渭拔稽c的分析。 4D-label free乙?;揎椀鞍捉M學是基于timsTOF Pro質(zhì)譜儀,通過數(shù)據(jù)依賴性采集-同步累積連續(xù)碎裂(ddaPASEF)掃描模式進行乙?;町惖鞍踪|(zhì)組學分析。4D-label free修飾組,利用了離子淌度分離,能根據(jù)分子的形狀、截面積屬性,可有效區(qū)分修飾同分異構(gòu)多肽,極大提高修飾的鑒定深度,以更少上樣量、更快掃描速度,實現(xiàn)蛋白質(zhì)組學在覆蓋深度、靈敏度、通量方面的全面性提升。

技術(shù)路線

技術(shù)優(yōu)勢

1. 4D技術(shù)加持,提高定量的準確性、鑒定深度,更加適合微量樣本;

2. 克服標記定量蛋白質(zhì)組學技術(shù)在樣本數(shù)量上的限制,靈活方便;

3. 基于質(zhì)譜平臺(Bruker timsTOF pro),檢測速度提升近一倍;

4. 經(jīng)驗豐富——超18年蛋白平臺服務(wù)經(jīng)驗,擁有豐富的高水平項目文章;

5. 數(shù)據(jù)保證——采用進口金標抗體,數(shù)據(jù)結(jié)果穩(wěn)定可靠;

6. 系統(tǒng)解決方案——提供修飾組學至驗證、上下游聯(lián)合分析,實現(xiàn)快捷”一站式”服務(wù)。

數(shù)據(jù)分析

1、標準數(shù)據(jù)分析內(nèi)容

鑒定分析:鑒定與定量結(jié)果統(tǒng)計;單個樣本蛋白質(zhì)鑒定結(jié)果統(tǒng)計;韋恩圖。

表達差異分析:差異結(jié)果統(tǒng)計;差異結(jié)果柱狀圖;火山圖;聚類分析圖。

多組的比較分析(組別>=3):mufzz聚類;雷達圖;箱線圖。

功能分析:亞細胞定位;結(jié)構(gòu)域分析;GO功能分析;KEGG通路分析;互作網(wǎng)絡(luò)分析。

質(zhì)量控制分析:肽段離子質(zhì)量偏差分布、肽段例子得分分布、蛋白質(zhì)豐度比分布。

2、高級數(shù)據(jù)分析

功能分析:GSEA富集分析。

臨床藥物研究:藥物靶點注釋。

標志物篩選:集成機器學習。

與臨床表征的聯(lián)合分析:熱圖;弦圖;ROC分析;WGCNA分析。

推薦組合產(chǎn)品

打通表型-機制研究:乙?;M+代謝組。

推薦應(yīng)用領(lǐng)域

能量代謝調(diào)控;

代謝綜合征研究;

真菌細菌研究。

樣品要求

項目案例
學術(shù)文章

蛋白質(zhì)乙?;揎?/p>

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