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N-糖基化蛋白質(zhì)組學(xué)

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N-糖基化蛋白質(zhì)組學(xué)

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項目介紹

     N糖基化是指蛋白質(zhì)在酶的作用下將糖鏈連接到蛋白質(zhì)特定氨基酸形成糖苷鍵的過程。細(xì)胞內(nèi)超過 50% 的蛋白質(zhì)都有一個或多個糖鏈。連接于天冬酰胺（Asn）殘基上的N-糖基化在真核生物中廣為存在，也是研究最為深入的一種糖基化形式。蛋白質(zhì)N-糖基化修飾主要在復(fù)雜的多細(xì)胞或組織形成過程中起關(guān)鍵作用，參與細(xì)胞識別、免疫應(yīng)答、細(xì)胞分化等生命活動。 蛋白質(zhì)經(jīng)酶解后利用凝集素（lectin）富集N-糖基化肽段，再用N-糖酰胺酶（PNGase）在重水中切除糖鏈，然后通過LC-MS/MS對糖基化位點(diǎn)進(jìn)行分析，實(shí)現(xiàn)大規(guī)模N-糖基化蛋白質(zhì)定性定量分析。

技術(shù)路線

數(shù)據(jù)分析

1、標(biāo)準(zhǔn)數(shù)據(jù)分析內(nèi)容

鑒定分析：鑒定與定量結(jié)果統(tǒng)計;單個樣本蛋白質(zhì)鑒定結(jié)果統(tǒng)計;韋恩圖。

表達(dá)差異分析：差異結(jié)果統(tǒng)計;差異結(jié)果柱狀圖;火山圖;聚類分析圖。

多組的比較分析(組別>=3)：mufzz聚類;雷達(dá)圖;箱線圖。

功能分析：亞細(xì)胞定位;結(jié)構(gòu)域分析;GO功能分析;KEGG通路分析;互作網(wǎng)絡(luò)分析。

質(zhì)量控制分析：肽段離子質(zhì)量偏差分布、肽段例子得分分布、蛋白質(zhì)豐度比分布。

2、高級數(shù)據(jù)分析

功能分析：GSEA富集分析。

臨床藥物研究：藥物靶點(diǎn)注釋。

標(biāo)志物篩選：集成機(jī)器學(xué)習(xí)。

與臨床表征的聯(lián)合分析：熱圖;弦圖;ROC分析;WGCNA分析。

推薦應(yīng)用領(lǐng)域

1. 信號轉(zhuǎn)導(dǎo)研究；

2. 基因表達(dá)調(diào)控研究；

3. 腫瘤發(fā)展機(jī)制研究。

樣品要求
樣品類型送樣量
動物組織類常規(guī)動物組織（心、肝、脾、肺、腎、肌肉等）30mg-1g
植物組織類柔軟組織（葉、花、藻類、大型真菌等）100mg-1g
微生物類菌類50mg-2g
細(xì)胞樣品懸浮細(xì)胞、貼壁細(xì)胞1.5-5×107


項目案例
學(xué)術(shù)文章

N-糖基化蛋白質(zhì)組學(xué)

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